Аурулардың молекулалық механизмдері зертханасы - біз ішкі құлақтың сенсорлық эпителийінің қалпына келуіне ықпал ететін жаңа дәрілік нысаналарды анықтау және сипаттау үшін сүтқоректілердегі тірек жасушаларының пролиферативті қабілетін шектейтін молекулалық механизмдерді ашуға тырысамыз.
• Жетекшісі - Анна Андреева

Жасушалық өсуді реттеу зертханасы - транскрипциялық факторлардың, атап айтқанда ядролық рецепторлардың функциялары мен әсерін түсіну арқылы эукариоттардың транскрипциялық реттеу механизмін зерттейді. Ядролық рецепторлар - адам ағзасындағы даму, энергетикалық гомеостаз және метаболизм сияқты барлық дерлік биологиялық процестермен байланысты белгілі бір гендерге бағытталған мырыш саусақтары бар ақуыздар. Оларды басқару белгілі бір мақсатты ген-нысаналарды белсендіру немесе репрессиялау үшін сигнал қосқыштары ретінде қызмет ететін шағын липофильді қосылыстарды, лигандтарды танумен байланысты. Ядролық рецепторлармен басқарылатын транскрипцияның реттелмеуі қатерлі ісік немесе метаболикалық аурулар сияқты әртүрлі ауруларға әкелетін функционалдық салдарға әкеледі. Бұл ақуыздардың молекулалық әсерін терең түсіну көптеген ауруларды емдеудің жаңа әдістерін бере алады. Біз ядролық рецепторлардың сигнализациясын модуляциялау арқылы метаболикалық аурулармен және қатерлі ісікпен күресу үшін пайдаланылуы мүмкін дәрілік препараттарға әлеуетті үміткерлер ретінде белгілі лигандтарды сынауға және жаңа лигандтарды анықтауға, олардың сау және ауру күйлердегі әсер ету механизмін түсінуге, осы білімді ауруды ерте диагностикалау немесе аурудың дамуын болдырмау үшін пайдалануға тырысамыз.
• Жетекшісі - Фердинанд Молнар

Дос Сарбасовтың тобы - сүтқоректілердің жасушаларында рибосомалардың жиналуын реттеу және оның қатерлі ісік кезіндегі қайта реттелуі, цитотоксикалық тотығу стрессін индукциялау арқылы қатерлі ісікке қарсы препараттарды әзірлеу.
• Жетекшісі - Дос Сарбасов

Биохимиялық иммунология зертханасы - иммунитеттегі G катепсинінің (CatG) функционалдық міндеттері, соның ішінде иммундық жүйеде CatG жаңа рөлін көрсететін I класты (MHC) гистосәйкестік кешенінің негізгі молекулаларының бивалентті реттелуі. Ерекше қызығушылықтар: Ісік жасушалары мен патогендерден иммундық жалтару, CatG протеолитикалық белсенділігінің модуляциясы, Т-жасушалардағы CatG функционалдық қасиеттері, иммуносенсивтілік.
• Жетекшісі - Тимо Берстер.

Соңғы басылымдар

• Nuta O, Rothkamm K, Darroudi F. The Role of Telomerase in Radiation-Induced Genomic Instability. Radiat Res. 2020 Mar 9. doi: 10.1667/RR15495.1.
• Wu X, Park M, Sarbassova DA, Ying H, Lee MG, Bhattacharya R, Ellis L, Peterson CB, Hung MC, Lin HK, Bersimbaev RI, Song MS, Sarbassov DD. A chirality-dependent action of vitamin C in suppressing Kirsten rat sarcoma mutant tumor growth by the oxidative combination: Rationale for cancer therapeutics. Int J Cancer. 2020 May 15;146(10):2822-2828. doi: 10.1002/ijc.32658.
• Schroeder R, Grzywa R, Wirtz CR, Sienczyk M, Burster T. Application of a novel FAM-conjugated activity-based probe to determine cathepsin G activity intracellularly. Anal Biochem. 2020;588:113488. doi:10.1016/j.ab.2019.113488.
• Myngbay A, Bexeitov Y, Adilbayeva A, Assylbekov Z, Yevstratenko BP, Aitzhanova RM, Matkarimov B, Adarichev VA, Kunz J. CTHRC1: A New Candidate Biomarker for Improved Rheumatoid Arthritis Diagnosis. Front Immunol. 2019 Jun 12;10:1353. doi: 10.3389/fimmu.2019.01353.
• Andreeva A, Bekkhozhin Z, Omertassova N, Baizhumanov T, Yeltay G, Akhmetali M, Toibazar D, Utepbergenov D. The apparent deglycase activity of DJ-1 results from the conversion of free methylglyoxal present in fast equilibrium with hemithioacetals and hemiaminals. J Biol Chem. 2019 Dec 6;294(49):18863-18872, doi: 10.1074/jbc.RA119.011237
• Shevtsova E, Vergnaud G, Shevtsov A, Shustov A, Berdimuratova K, Mukanov K, Syzdykov M, Kuznetsov A, Lukhnova L, Izbanova U, Filipenko M, Ramankulov Y. Genetic Diversity of Brucella melitensis in Kazakhstan in Relation to World-Wide Diversity. Front Microbiol. 2019 Aug 13;10:1897. doi: 10.3389/fmicb.2019.01897.
• Dammann F, Kirschstein T, Guli X, Müller S, Porath K, Rohde M, Tokay T, Köhling R. Bidirectional shift of group III metabotropic glutamate receptor-mediated synaptic depression in the epileptic hippocampus. Epilepsy Res. 2018 Jan;139:157-163. doi: 10.1016/j.eplepsyres.2017.12.002.

Өкілдік басылымдар:

• Veremeyko T, Kuznetsova IS, Dukhinova M, W Y Yung A, Kopeikina E, Barteneva NS, Ponomarev ED. Neuronal extracellular microRNAs miR-124 and miR-9 mediate cell-cell communication between neurons and microglia. J Neurosci Res. 2019;97(2):162‐184. doi:10.1002/jnr.24344
• Pham TT, Monnard A, Helenius J, Lund E, Lee N, Müller DJ, Cabernard C. Spatiotemporally Controlled Myosin Relocalization and Internal Pressure Generate Sibling Cell Size Asymmetry. iScience. 2019 Mar 29;13:9-19. doi: 10.1016/j.isci.2019.02.002.
• Potashnikova DM, Golyshev SA, Penin AA, Logacheva MD, Klepikova AV, Zharikova AA, Mironov AA, Sheval EV, Vorobjev IA. FACS Isolation of Viable Cells in Different Cell Cycle Stages from Asynchronous Culture for RNA Sequencing. Methods Mol Biol. 2018;1745:315-335. doi: 10.1007/978-1-4939-7680-5_18.
• Dashkova V, Clapper J, Vorobjev IA, Barteneva NS. Spectral and Imaging Flow Cytometry in Phytoplankton Research. Methods Mol Biol. 2018;1745:83-95. doi:10.1007/978-1-4939-7680-5_5
• Trifonova RT, Barteneva NS. Quantitation of IRF3 Nuclear Translocation in Heterogeneous Cellular Populations from Cervical Tissue Using Imaging Flow Cytometry. Methods Mol Biol. 2018;1745:125-153.
• Guney M, Yagofarova A, Yapiyev V, Schönbach C, Kim JR, Inglezakis VJ. Distribution of potentially toxic soil elements along a transect across Kazakhstan. Geoderma Regional. 2020; 21, e00281. doi.org/10.1016/j.geodrs.2020.e00281
• Roubinet C, Tsankova A*, Pham TT*, Monnard A, Caussinus E, Affolter M, Cabernard C. Spatio-temporally separated cortical flows and spindle geometry establish physical asymmetry in fly neural stem cells. Nat Commun. 2017 Nov 9;8(1):1383. doi: 10.1038/s41467-017-01391-w.*equal contribution

Өкілдік басылымдар:

• Sypabekova M, Dukenbayev K, Tsepke A, Akisheva A, Oralbayev N, Kanayeva D. An aptasensor for the detection of Mycobacterium tuberculosis secreted immunogenic protein MPT64 in clinical samples towards tuberculosis detection. Sci Rep. 2019 Nov 7;9(1):16273. doi: 10.1038/s41598-019-52685-6
• Xie Y, Fan H, Lu W, Yang Q, Nurkesh A, Yeleussizov T, Maipas A, Lu J, Manarbek L, Chen Z, Benassi E. Nuclear MET requires ARF and is inhibited by carbon nanodots through binding to phospho-tyrosine in prostate cancer. Oncogene. 2019 Apr;38(16):2967-2983. doi: 10.1038/s41388-018-0608-2
• Ranganathan S, Gribskov M, Nakai K, Schönbach C (Editors-in-Chief). Encyclopedia of Bioinformatics and Computational Biology (The A to Z of Bioinformatics). Volume 1-3, 1st Edition. pp. 1-3284, Elsevier, 2019. ISBN (ebook): 978-0-128-114322; August 31, 2018; ISBN (Print): ISBN 978-0-128-114148. January 1, 2019.
• Sun X, Shi Y, Akahoshi T, Fujiwara M, Gatanaga H, Schönbach C, Kuse N, Appay V, Gao GF, Oka S, Takiguchi M. Effects of a Single Escape Mutation on T Cell and HIV-1 Co-adaptation. Cell Rep. 2016 Jun 7;15(10):2279-2291. doi: 10.1016/j.celrep.2016.05.017.
• Sayyar B, Dodd M, Marquez-Curtis L, Janowska-Wieczorek A, Hortelano G. Fibronectin-Alginate microcapsules improve cell viability and protein secretion of encapsulated Factor IX-engineered human mesenchymal stromal cells. Artif Cells Nanomed Biotechnol. 2015;43(5):318-27. doi.org/10.3109/21691401.2014.885446