School of Sciences and Humanities
School of Sciences and Humanities
School of Sciences and Humanities
Департамент биологии
Единое здоровье и биоразнообразие
На биологическом факультете работают ученые, интересующиеся темами единого здоровья и биоразнообразия, которые проводят исследования в рамках проекта C4 BioCluster:
- биофотоника, применяемая в клеточной биологии, биологии рака и экологических системах
- молекулярные основы заболеваний человека, включая рак, инфекционные заболевания, аутоиммунитет и неврологические заболевания,
- биотехнологии, биосенсоры, доставка наночастиц и биоинформатика
Исследовательские направления биокластера C4
Лаборатория молекулярных механизмов болезней - мы стремимся раскрыть молекулярные механизмы, ограничивающие пролиферативную способность опорных клеток у млекопитающих, в надежде выявить и охарактеризовать новые лекарственные мишени, способствующие регенерации сенсорного эпителия внутреннего уха.
Лаборатория регуляции клеточного роста - наша группа изучает механизм транскрипционной регуляции эукариот, понимая функции и действие транскрипционных факторов, а именно ядерных рецепторов. Ядерные рецепторы - это белки, содержащие цинковые пальцы, нацеленные на определенные гены, связанные почти со всеми биологическими процессами в организме человека, такими как развитие, энергетический гомеостаз и метаболизм. Их управление связано с распознаванием небольших липофильных соединений, лигандов, которые служат сигнальными переключателями для активации или репрессии определенных генов-мишеней. Дисрегуляция транскрипции, направляемой ядерными рецепторами, имеет функциональные последствия, которые приводят к различным заболеваниям, таким как рак или метаболические болезни. Глубокое понимание молекулярного действия этих белков может дать новые средства для лечения многих заболеваний. Мы стремимся протестировать хорошо известные и выявить новые лиганды в качестве потенциальных кандидатов в лекарственные препараты, которые могут быть использованы для борьбы с метаболическими заболеваниями и раком посредством модуляции сигнализации ядерных рецепторов, понять механизм их действия в здоровых и больных состояниях, чтобы использовать эти знания для ранней диагностики или предотвращения развития заболеваний.
Группа Доса Сарбасова - регуляция сборки рибосом в клетках млекопитающих и ее дерегуляция при раке, разработка лекарств против рака путем индуцирования цитотоксического окислительного стресса.
Публикации:
- Руководитель - Анна Андреева
Лаборатория регуляции клеточного роста - наша группа изучает механизм транскрипционной регуляции эукариот, понимая функции и действие транскрипционных факторов, а именно ядерных рецепторов. Ядерные рецепторы - это белки, содержащие цинковые пальцы, нацеленные на определенные гены, связанные почти со всеми биологическими процессами в организме человека, такими как развитие, энергетический гомеостаз и метаболизм. Их управление связано с распознаванием небольших липофильных соединений, лигандов, которые служат сигнальными переключателями для активации или репрессии определенных генов-мишеней. Дисрегуляция транскрипции, направляемой ядерными рецепторами, имеет функциональные последствия, которые приводят к различным заболеваниям, таким как рак или метаболические болезни. Глубокое понимание молекулярного действия этих белков может дать новые средства для лечения многих заболеваний. Мы стремимся протестировать хорошо известные и выявить новые лиганды в качестве потенциальных кандидатов в лекарственные препараты, которые могут быть использованы для борьбы с метаболическими заболеваниями и раком посредством модуляции сигнализации ядерных рецепторов, понять механизм их действия в здоровых и больных состояниях, чтобы использовать эти знания для ранней диагностики или предотвращения развития заболеваний.
- Руководитель - Фердинанд Молнар
Группа Доса Сарбасова - регуляция сборки рибосом в клетках млекопитающих и ее дерегуляция при раке, разработка лекарств против рака путем индуцирования цитотоксического окислительного стресса.
- Руководитель - Дос Сарбасов
Лаборатория биохимической иммунологии - функциональные обязанности катепсина G (CatG) в иммунитете, включая бивалентную регуляцию основных молекул комплекса гистосовместимости класса I (MHC), которые подчеркивают новую роль CatG в иммунной системе. Особые интересы: Иммунное уклонение от опухолевых клеток и патогенов, модуляция протеолитической активности CatG, функциональные свойства CatG в Т-клетках, иммуносенситивность.
- Руководитель - Тимо Бёрстер.
Публикации:
- Nuta O, Rothkamm K, Darroudi F. The Role of Telomerase in Radiation-Induced Genomic Instability. Radiat Res. 2020 Mar 9. doi: 10.1667/RR15495.1.
- Wu X, Park M, Sarbassova DA, Ying H, Lee MG, Bhattacharya R, Ellis L, Peterson CB, Hung MC, Lin HK, Bersimbaev RI, Song MS, Sarbassov DD. A chirality-dependent action of vitamin C in suppressing Kirsten rat sarcoma mutant tumor growth by the oxidative combination: Rationale for cancer therapeutics. Int J Cancer. 2020 May 15;146(10):2822-2828. doi: 10.1002/ijc.32658.
- Schroeder R, Grzywa R, Wirtz CR, Sienczyk M, Burster T. Application of a novel FAM-conjugated activity-based probe to determine cathepsin G activity intracellularly. Anal Biochem. 2020;588:113488. doi:10.1016/j.ab.2019.113488.
- Myngbay A, Bexeitov Y, Adilbayeva A, Assylbekov Z, Yevstratenko BP, Aitzhanova RM, Matkarimov B, Adarichev VA, Kunz J. CTHRC1: A New Candidate Biomarker for Improved Rheumatoid Arthritis Diagnosis. Front Immunol. 2019 Jun 12;10:1353. doi: 10.3389/fimmu.2019.01353.
- Andreeva A, Bekkhozhin Z, Omertassova N, Baizhumanov T, Yeltay G, Akhmetali M, Toibazar D, Utepbergenov D. The apparent deglycase activity of DJ-1 results from the conversion of free methylglyoxal present in fast equilibrium with hemithioacetals and hemiaminals. J Biol Chem. 2019 Dec 6;294(49):18863-18872, doi: 10.1074/jbc.RA119.011237
- Shevtsova E, Vergnaud G, Shevtsov A, Shustov A, Berdimuratova K, Mukanov K, Syzdykov M, Kuznetsov A, Lukhnova L, Izbanova U, Filipenko M, Ramankulov Y. Genetic Diversity of Brucella melitensis in Kazakhstan in Relation to World-Wide Diversity. Front Microbiol. 2019 Aug 13;10:1897. doi: 10.3389/fmicb.2019.01897.
- Dammann F, Kirschstein T, Guli X, Müller S, Porath K, Rohde M, Tokay T, Köhling R. Bidirectional shift of group III metabotropic glutamate receptor-mediated synaptic depression in the epileptic hippocampus. Epilepsy Res. 2018 Jan;139:157-163. doi: 10.1016/j.eplepsyres.2017.12.002.
Публикации:
- Veremeyko T, Kuznetsova IS, Dukhinova M, W Y Yung A, Kopeikina E, Barteneva NS, Ponomarev ED. Neuronal extracellular microRNAs miR-124 and miR-9 mediate cell-cell communication between neurons and microglia. J Neurosci Res. 2019;97(2):162‐184. doi:10.1002/jnr.24344
- Pham TT, Monnard A, Helenius J, Lund E, Lee N, Müller DJ, Cabernard C. Spatiotemporally Controlled Myosin Relocalization and Internal Pressure Generate Sibling Cell Size Asymmetry. iScience. 2019 Mar 29;13:9-19. doi: 10.1016/j.isci.2019.02.002.
- Potashnikova DM, Golyshev SA, Penin AA, Logacheva MD, Klepikova AV, Zharikova AA, Mironov AA, Sheval EV, Vorobjev IA. FACS Isolation of Viable Cells in Different Cell Cycle Stages from Asynchronous Culture for RNA Sequencing. Methods Mol Biol. 2018;1745:315-335. doi: 10.1007/978-1-4939-7680-5_18.
- Dashkova V, Clapper J, Vorobjev IA, Barteneva NS. Spectral and Imaging Flow Cytometry in Phytoplankton Research. Methods Mol Biol. 2018;1745:83-95. doi:10.1007/978-1-4939-7680-5_5
- Trifonova RT, Barteneva NS. Quantitation of IRF3 Nuclear Translocation in Heterogeneous Cellular Populations from Cervical Tissue Using Imaging Flow Cytometry. Methods Mol Biol. 2018;1745:125-153.
- Guney M, Yagofarova A, Yapiyev V, Schönbach C, Kim JR, Inglezakis VJ. Distribution of potentially toxic soil elements along a transect across Kazakhstan. Geoderma Regional. 2020; 21, e00281. doi.org/10.1016/j.geodrs.2020.e00281
- Roubinet C, Tsankova A*, Pham TT*, Monnard A, Caussinus E, Affolter M, Cabernard C. Spatio-temporally separated cortical flows and spindle geometry establish physical asymmetry in fly neural stem cells. Nat Commun. 2017 Nov 9;8(1):1383. doi: 10.1038/s41467-017-01391-w.*equal contribution
Публикации:
- Sypabekova M, Dukenbayev K, Tsepke A, Akisheva A, Oralbayev N, Kanayeva D. An aptasensor for the detection of Mycobacterium tuberculosis secreted immunogenic protein MPT64 in clinical samples towards tuberculosis detection. Sci Rep. 2019 Nov 7;9(1):16273. doi: 10.1038/s41598-019-52685-6
- Xie Y, Fan H, Lu W, Yang Q, Nurkesh A, Yeleussizov T, Maipas A, Lu J, Manarbek L, Chen Z, Benassi E. Nuclear MET requires ARF and is inhibited by carbon nanodots through binding to phospho-tyrosine in prostate cancer. Oncogene. 2019 Apr;38(16):2967-2983. doi: 10.1038/s41388-018-0608-2
- Ranganathan S, Gribskov M, Nakai K, Schönbach C (Editors-in-Chief). Encyclopedia of Bioinformatics and Computational Biology (The A to Z of Bioinformatics). Volume 1-3, 1st Edition. pp. 1-3284, Elsevier, 2019. ISBN (ebook): 978-0-128-114322; August 31, 2018; ISBN (Print): ISBN 978-0-128-114148. January 1, 2019.
- Sun X, Shi Y, Akahoshi T, Fujiwara M, Gatanaga H, Schönbach C, Kuse N, Appay V, Gao GF, Oka S, Takiguchi M. Effects of a Single Escape Mutation on T Cell and HIV-1 Co-adaptation. Cell Rep. 2016 Jun 7;15(10):2279-2291. doi: 10.1016/j.celrep.2016.05.017.
- Sayyar B, Dodd M, Marquez-Curtis L, Janowska-Wieczorek A, Hortelano G. Fibronectin-Alginate microcapsules improve cell viability and protein secretion of encapsulated Factor IX-engineered human mesenchymal stromal cells. Artif Cells Nanomed Biotechnol. 2015;43(5):318-27. doi.org/10.3109/21691401.2014.885446
Публикации
2021
- Zhadyra Mustafa, Anuar Zhanapiya, Hubert Kalbacher, and Timo Burster. Neutrophil elastase and protein-ase 3 cleavage sites are adjacent to the polybasic sequence within the proteolytic sensitive activation loop of the SARS-CoV-2 spike protein. 2021. ACS Omega. IF: 2.87
- Patricia Kattner, Katharina Zeiler, Verena J. Herbener, Katia La Ferla-Brühl, Rebecca Kassubek, Michael Grunert, Timo Burster, Oliver Brühl, Anna Sarah Weber, Hannah Strobel, Georg Karpel-Massler, Sibylle Ott, Alexa Hagedorn, Daniel Tews, Ansgar Schulz, Vikas Prasad, Markus D. Siegelin, Lisa Nonnenmacher, Pamela Fischer-Posovszky, Marc-Eric Halatsch, Klaus-Michael Debatin, Mike-Andrew Westhoff. What animal cancers teach us about human biology. 2021. Theranostics. Review. IF: 8.579
- Timo Burster, Fabian Gärtner, Uwe Knippschild, Anuar Zhanapiya. Activity-based probes to utilize the proteolytic activity of cathepsin G in biological samples. 2021. Feb. Frontiers in Chemistry. Invited Review. IF: 3.693.5.
- Fabian Gärtner, Uwe Knippschild, and Timo Burster. Application of an activity-based probe to deter-mine proteolytic activity of cell surface cathepsin G by mass cytometry data acquisition. ACS Omega. 2020. Oct 19;5(43):28233-28238. IF: 2.87
- Pengfei Xu; Fabian Gärtner; Adrian Gihring; Congxing Liu; Timo Burster; Martin Wabitsch; Uwe Knipp-schild; Stephan Paschke. Influence of obesity on remodeling of lung tissue and organization of extracellular matrix after blunt thorax trauma. Respiratory Research. 2020. Sep 17;21(1):238. IF: 3.89
- Timo Burster, Fabian Gärtner, Christiane Bulach, Anuar Zhanapiya, Adrian Gihring, and Uwe Knippschild. Regulation of MHC I molecules in glioblastoma cells and the sensitizing of NK cells. 2021. Pharmaceuticals. Invited Review. IF: 4.286
- Herbener, Goreth, Pruss, Burster, Bandemer, Baisch, Fitzel, Siegelin, Karpel-Massler, Debatin, Strobel, Westhoff. Considering the experimental use of Temozolomide in Glioblastoma research. Biomedicines. 2020. Jun 4;8(6):E151. Invited Review. IF: 4.717
- Burster, Knippschild, Molnar, and Zhanapiya. Cathepsin G and its role in modulating levels of MHC class I molecules. Archivum Immunologiae et Therapiae Experimentalis (AITE). 2020. Aug 19;68(4):25. Invited Review. IF: 2.85